{"id":13747,"date":"2022-06-16T10:12:27","date_gmt":"2022-06-16T10:12:27","guid":{"rendered":"https:\/\/socgastro.org.br\/novo\/?p=13747"},"modified":"2022-05-24T13:29:58","modified_gmt":"2022-05-24T13:29:58","slug":"oncokb-primeiro-banco-de-dados-de-variantes-somaticas-de-cancer-humano-endossado-pela-fda","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/socgastro.org.br\/novo\/2022\/06\/oncokb-primeiro-banco-de-dados-de-variantes-somaticas-de-cancer-humano-endossado-pela-fda\/","title":{"rendered":"OncoKB: primeiro banco de dados de variantes som\u00e1ticas de c\u00e2ncer humano endossado pela FDA"},"content":{"rendered":"<p>fonte: MedScape<\/p>\n<p>Desde a aprova\u00e7\u00e3o do primeiro\u00a0<a href=\"https:\/\/emedicine.medscape.com\/article\/1372666-overview\">tratamento antineopl\u00e1sico direcionado<\/a>, h\u00e1 20 anos, at\u00e9 hoje, mais de 100 medicamentos j\u00e1 foram aprovados ou est\u00e3o em pesquisa. Estes produtos oferecem uma estrat\u00e9gia diferente do bombardeio da quimioterapia \u2013 s\u00e3o m\u00edsseis precisos, que miram alvos predeterminados da gen\u00e9tica tumoral.<\/p>\n<p>Mas quais s\u00e3o esses alvos? Em que tumores?<\/p>\n<p>H\u00e1 uma preocupa\u00e7\u00e3o crescente entre oncologistas de que a enxurrada de informa\u00e7\u00f5es sobre biomarcadores que vem os atingindo esteja causando confus\u00e3o e fazendo com que os pacientes deixem de receber tratamentos eficazes.<\/p>\n<p>Um novo banco de dados quer mudar tudo isso.<\/p>\n<p>No m\u00eas passado, a\u00a0<em>Food and Drug Administration<\/em>\u00a0(FDA) dos Estados Unidos concedeu seu primeiro reconhecimento de um banco de conhecimentos de oncologia de precis\u00e3o que relaciona biomarcadores gen\u00e9ticos a tipos espec\u00edficos de c\u00e2ncer \u2013 a\u00a0<em>Memorial Sloan Kettering Cancer Center&#8217;s Oncology Knowledge Base<\/em>\u00a0(<a href=\"https:\/\/www.oncokb.org\/\">\u00a0<em>OncoKB<\/em>\u00a0<\/a>).<\/p>\n<p>&#8220;As origens da\u00a0<em>OncoKB<\/em>\u00a0est\u00e3o arraigadas no reconhecimento de que era pedir demais aos oncologistas para memorizarem o n\u00famero cada vez maior de muta\u00e7\u00f5es tumorais espec\u00edficas que podem agir como biomarcadores preditivos para tratamentos direcionados&#8221;, disse a Dra. Debyani Chakravarty, Ph.D., Cientista\u00a0<em>Chefe da OncoKB\u00a0<\/em>no<em>\u00a0Memorial Sloan Kettering Cancer Center for Molecular Oncology<\/em>.<\/p>\n<p>&#8220;Um sistema de apoio \u00e0 decis\u00e3o cl\u00ednica para fornecer essas informa\u00e7\u00f5es no local de atendimento era urgentemente necess\u00e1rio&#8221;, acrescentou a cientista.<\/p>\n<p>A\u00a0<em>OncoKB<\/em>\u00a0fez sua estreia p\u00fablica em 16 de maio de 2017, com a publica\u00e7\u00e3o de um artigo pela Dra. Debyani e seus colaboradores no peri\u00f3dico\u00a0<em>JCO Precision Oncology<\/em>. \u00c0 \u00e9poca, o banco de dados apresentava n\u00edveis de evid\u00eancia com curadoria humana de mais de 3.000 altera\u00e7\u00f5es em 418 genes associados ao c\u00e2ncer, para 19 tipos de c\u00e2ncer. Atualmente, a lista cont\u00e9m 5.685 altera\u00e7\u00f5es em 682 genes em 127 tipos de c\u00e2ncer.<\/p>\n<p>Em outubro, a\u00a0<em>OncoKB<\/em>\u00a0se tornou o primeiro banco de dados de muta\u00e7\u00e3o tumoral a ser fazer parte do\u00a0<a href=\"https:\/\/www.fda.gov\/media\/99200\/download\">programa de reconhecimento de banco de dados<\/a>\u00a0da FDA.<\/p>\n<p>M\u00e9dicos e pesquisadores podem avaliar as evid\u00eancias que relacionam combina\u00e7\u00f5es de c\u00e2ncer, biomarcadores gen\u00e9ticos e medicamentos por meio de uma interface simples.<\/p>\n<p>&#8220;\u00c9 dif\u00edcil descobrir o que \u00e9 ou n\u00e3o uma muta\u00e7\u00e3o acion\u00e1vel sem esse tipo de dado&#8221;, disse o bi\u00f3logo Dr. Timothy Rebbeck, Ph.D., professor de preven\u00e7\u00e3o de c\u00e2ncer no\u00a0<em>Dana-Farber Cancer Institute<\/em>\u00a0nos EUA, que foi convidado a comentar para o\u00a0<em>Medscape<\/em>.<\/p>\n<p>O Dr. Timothy disse que o aceno da FDA para a\u00a0<em>OncoKB<\/em>\u00a0faz sentido, afirmando que, diante das implica\u00e7\u00f5es terap\u00eauticas dessas muta\u00e7\u00f5es, o envolvimento da FDA faz-se relevante.<\/p>\n<p>Existem muitos bancos de dados gen\u00f4micos acerca do c\u00e2ncer. A lista conta com o\u00a0<a href=\"http:\/\/www.cbioportal.org\/\"><em>CBioPortal<\/em>\u00a0<\/a>do pr\u00f3prio\u00a0<em>Memorial Sloan Kettering Cancer Center<\/em>, bem como\u00a0<a href=\"https:\/\/www.mycancergenome.org\/\"><em>MyCancerGenome<\/em>\u00a0<\/a>,\u00a0<a href=\"https:\/\/eipm.weill.cornell.edu\/resources\/precision-medicine-knowledgebase\/\"><em>Precision Medicine Knowledge Base<\/em>\u00a0<\/a>,\u00a0<a href=\"https:\/\/www.cancergenomeinterpreter.org\/home\"><em>Cancer Genome Interpreter<\/em>\u00a0<\/a>,\u00a0<a href=\"https:\/\/candl.osu.edu\/\"><em>Cancer Driver Log<\/em>\u00a0<\/a>,\u00a0<a href=\"http:\/\/www.tumorportal.org\/\"><em>Tumor Portal<\/em>\u00a0<\/a>, entre outros.<\/p>\n<p>A Dra. Debyani reconhece que a\u00a0<em>OncoKB<\/em>\u00a0n\u00e3o est\u00e1 sozinha. &#8220;Mas dito isso, \u00e9 agora o primeiro banco de dados de variantes som\u00e1ticas de c\u00e2ncer humano a ser reconhecido pela FDA&#8221;, acrescentou a pesquisadora.<\/p>\n<p>No cora\u00e7\u00e3o da\u00a0<em>OncoKB<\/em>\u00a0\u00e9 um processo cont\u00ednuo de curadoria do qual participam mais de 50 m\u00e9dicos e geneticistas no centro oncol\u00f3gico. &#8220;Encontramos uma maneira de codificar a experi\u00eancia cient\u00edfica e cl\u00ednica dos oncologistas do\u00a0<em>Memorial Sloan Kettering<\/em>&#8220;, disse Dra. Debyani.<\/p>\n<p>A equipe se faz tr\u00eas perguntas aparentemente simples: o que \u00e9 o gene, se a muta\u00e7\u00e3o nesse gene \u00e9 ou n\u00e3o oncog\u00eanica e, quando encontrada em um tipo espec\u00edfico de tumor, quais s\u00e3o as implica\u00e7\u00f5es terap\u00eauticas associadas.<\/p>\n<p>Os dados de embasamento s\u00e3o ent\u00e3o atribu\u00eddos a um\u00a0<a href=\"https:\/\/www.oncokb.org\/levels\">n\u00edvel terap\u00eautico de evid\u00eancia\u00a0<em>OncoKB<\/em>\u00a0<\/a>em uma escala que vai de &#8220;atendimento habitual&#8221; at\u00e9 &#8220;hipot\u00e9tico&#8221;.<\/p>\n<p>&#8220;O que mais me surpreendeu foi que o simples fato de obter essas tr\u00eas informa\u00e7\u00f5es e assegurar sua acur\u00e1cia foi um grande desafio&#8221;, disse a Dra. Debyani.<\/p>\n<p>O novo reconhecimento da FDA \u00e9 considerado \u201cparcial\u201d, porque n\u00e3o cobre toda a\u00a0<em>OncoKB<\/em>: a ag\u00eancia n\u00e3o revisou todas as rela\u00e7\u00f5es entre os medicamentos e biomarcadores no\u00a0<em>site<\/em>. No entanto, os desenvolvedores da\u00a0<em>OncoKB<\/em>\u00a0criaram \u2013 e submeteram ao reconhecimento \u2013 uma zona espec\u00edfica da FDA que lista biomarcadores oncol\u00f3gicos que j\u00e1 t\u00eam luz verde regulat\u00f3ria nos Estados Unidos.<\/p>\n<p>A zona da\u00a0<em>OncoKB<\/em>\u00a0reconhecida pela FDA traz dados semelhantes aos do restante do\u00a0<em>site<\/em>, mas \u00e9 categorizada usando o pr\u00f3prio sistema de n\u00edvel de evid\u00eancias da FDA.<\/p>\n<p>A FDA atribui\u00a0<a href=\"https:\/\/www.oncokb.org\/levels#version=FDA_NGS\">um de tr\u00eas n\u00edveis de evid\u00eancias<\/a>\u00a0para as variantes gen\u00e9ticas nas solicita\u00e7\u00f5es de regulamenta\u00e7\u00e3o que recebe. O n\u00edvel 1 \u00e9 reservado para diagn\u00f3sticos de acompanhamento aprovados para tratamentos direcionados; o n\u00edvel 2 \u00e9 atribu\u00eddo a &#8220;muta\u00e7\u00f5es oncog\u00eanicas com evid\u00eancias de significado cl\u00ednico&#8221;; e o n\u00edvel 3 indica &#8220;muta\u00e7\u00f5es de c\u00e2ncer com potencial significado cl\u00ednico&#8221;.<\/p>\n<p>A zona da\u00a0<em>OncoKB<\/em>\u00a0atualmente reconhecida pela FDA lista 46 genes acion\u00e1veis em 40 tipos de c\u00e2ncer com evid\u00eancias de n\u00edvel 2 e 38 genes acion\u00e1veis em 33 tipos de c\u00e2ncer com evid\u00eancias de n\u00edvel 3.<\/p>\n<p>As primeiras\u00a0<a href=\"https:\/\/www.fda.gov\/medical-devices\/precision-medicine\/fda-recognition-public-human-genetic-variant-databases\">orienta\u00e7\u00f5es<\/a>\u00a0da FDA sobre como obter o endosso de um banco de dados de variantes gen\u00e9ticas foram publicadas em abril de 2018. Tendo em mente que a gen\u00f4mica do c\u00e2ncer \u00e9 um campo enorme e com muita energia, o\u00a0<em>Medscape<\/em>\u00a0perguntou \u00e0 FDA por que levou tr\u00eas anos e meio para reconhecer um banco de dados de muta\u00e7\u00e3o tumoral.<\/p>\n<p>O porta-voz da ag\u00eancia, Jim Mckinney, colocou o \u00f4nus na solicita\u00e7\u00e3o de oficializa\u00e7\u00e3o por parte dos criadores do banco de dados: &#8220;A FDA n\u00e3o pode direcionar entidades externas para solicitar o reconhecimento de um banco de dados junto \u00e0 ag\u00eancia&#8221;, disse. Quanto \u00e0\u00a0<em>OncoKB<\/em>, a linha do tempo de revis\u00e3o foi &#8220;impactada pela pandemia de covid-19, que afetou os recursos institucionais&#8221;.<\/p>\n<p>Jim n\u00e3o disse quantos outros bancos de dados gen\u00e9ticos de oncologia a FDA est\u00e1 avaliando em vistas do reconhecimento, mas confirmou que o reconhecimento parcial da\u00a0<em>OncoKB<\/em>\u00a0pela FDA significa que &#8220;os que pesquisam novos tipos de exames podem usar esses dados para embasar a validade cl\u00ednica dos exames de perfil tumoral em suas solicita\u00e7\u00f5es pr\u00e9-comercializa\u00e7\u00e3o&#8221;.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>fonte: MedScape Desde a aprova\u00e7\u00e3o do primeiro\u00a0tratamento antineopl\u00e1sico direcionado, h\u00e1 20 anos, at\u00e9 hoje, mais de 100 medicamentos j\u00e1 foram [&hellip;]<\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"closed","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[2],"tags":[],"class_list":["post-13747","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-noticias"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/socgastro.org.br\/novo\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/13747","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/socgastro.org.br\/novo\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/socgastro.org.br\/novo\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/socgastro.org.br\/novo\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/socgastro.org.br\/novo\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=13747"}],"version-history":[{"count":1,"href":"https:\/\/socgastro.org.br\/novo\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/13747\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":13749,"href":"https:\/\/socgastro.org.br\/novo\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/13747\/revisions\/13749"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/socgastro.org.br\/novo\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=13747"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/socgastro.org.br\/novo\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=13747"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/socgastro.org.br\/novo\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=13747"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}